ВЫСОКО КОНСЕРВАТИВНЫЕ ЭЛЕМЕНТЫ В МИТОХОНДРИЯХ ОДНОДОЛЬНЫХ РАСТЕНИЙ
Аннотация
Статья нацелена на поиск высоко консервативных элементов в геномах митохондрий однодольных растений. Полученные результаты о распределении ВКЭ хорошо согласуются с общепринятым деревом видов класса однодольных растений.
Литература
2. de Graaf R.M., Ricard G., van Alen T.A., Duarte I., Dutilh B.E., Burgtorf C., Kuiper J.W., van der Staay G.W., Tielens A.G., Huynen M.A., Hackstein J.H. The organellar genome and metabolic potential of the hydrogen-producing mitochondrion of Nyctotherus ovalis // Mol. Biol. Evol. 2011. V. 28, no. 8. P. 2379–2391. DOI: 10.1093/molbev/msr059
3. Rubanov L.I., Seliverstov A.V., Zverkov O.A., Lyubetsky V.A. A method for identification of highly conserved elements and evolutionary analysis of superphylum Alveolata. BMC Bioinformatics. 2016 17:385 DOI 10.1186/s12859-016-1257-5
4. Ильев В.П., Ильева С.Д., Навроцкая А.А. О задаче кластеризации графа с ограничением на размеры кластеров //Дискретный анализ и исследование операций. 2016. Т. 23, № 3. С. 5–20. DOI: 10.17377/daio.2016.23.521
5. Van Dongen S. Graph clustering via a discrete uncoupling process // SIAM J. Matrix Anal. Appl. 2008. V. 30, №1.P.121–141.DOI:10.1137/040608635
6. Stamatakis A. RAxML version 8: a tool for phylogenetic analysis and post-analysis of large phylogenies // Bioinformatics. 2014. V. 30, no. 9. P. 1312–1313. DOI: 10.1093/bioinformatics/btu033
7. Селиверстов А.В., Лысенко Е.А., Любецкий В.А. Быстрая эволюция промоторов пластомных генов ndhF у цветковых растений //Физиология растений. 2009. Т. 56, № 6. С. 926–934.
8. Lyubetsky V.A., Rubanov L.I., Seliverstov A.V. Lack of conservation of bacterial type promoters in plastids of Streptophyta// Biology Direct. 2010. V. 5, no. 34. DOI: 10.1186/1745-6150-5-34
9. Bailey T.L., Bodén M., Buske F.A., Frith M., Grant C.E., Clementi L., Ren J., Li W.W., Noble W.S., MEME SUITE: tools for motif discovery and searching // Nucleic Acids Research. 2009. V. 37. P. W202-W208.
10. Nawrocki E.P., Burge S.W., Bateman A., Daub J., Eberhardt R.Y., Eddy S.R., Floden E.W., Gardner P.P., Jones T.A., Tate J., Finn R.D. Rfam 12.0: updates to the RNA families database // Nucleic Acids Research. 2015. V. 43, no. D1. P. D130–D137. DOI:10.1093/nar/gku1063
11. Рубанов Л.И. О распараллеливании неоднородных циклов на суперкомпьютерах с распределённой памятью // Информационные процессы. 2013. Т. 13, № 4. С. 295–305.
Это произведение доступно по лицензии Creative Commons «Attribution» («Атрибуция») 4.0 Всемирная.
Редакционная политика журнала основывается на традиционных этических принципах российской научной периодики и строится с учетом этических норм работы редакторов и издателей, закрепленных в Кодексе поведения и руководящих принципах наилучшей практики для редактора журнала (Code of Conduct and Best Practice Guidelines for Journal Editors) и Кодексе поведения для издателя журнала (Code of Conduct for Journal Publishers), разработанных Комитетом по публикационной этике - Committee on Publication Ethics (COPE). В процессе издательской деятельности редколлегия журнала руководствуется международными правилами охраны авторского права, нормами действующего законодательства РФ, международными издательскими стандартами и обязательной ссылке на первоисточник.
Журнал позволяет авторам сохранять авторское право без ограничений. Журнал позволяет авторам сохранить права на публикацию без ограничений.
Издательская политика в области авторского права и архивирования определяются «зеленым цветом» в базе данных SHERPA/RoMEO.
Все статьи распространяются на условиях лицензии Creative Commons «Attribution» («Атрибуция») 4.0 Всемирная, которая позволяет другим использовать, распространять, дополнять эту работу с обязательной ссылкой на оригинальную работу и публикацию в этом журналe.
