ВЫСОКО КОНСЕРВАТИВНЫЕ ЭЛЕМЕНТЫ В МИТОХОНДРИЯХ ОДНОДОЛЬНЫХ РАСТЕНИЙ

  • Лев Израилевич Рубанов Институт проблем передачи информации им. А.А. Харкевича Российской академии наук
  • Олег Анатольевич Зверков Институт проблем передачи информации им. А.А. Харкевича Российской академии наук
  • Александр Владиславович Селиверстов Институт проблем передачи информации им. А.А. Харкевича Российской академии наук
  • Василий Александрович Любецкий Институт проблем передачи информации им. А.А. Харкевича Российской академии наук

Abstract

Статья нацелена на поиск высоко консервативных элементов в геномах митохондрий однодольных растений. Полученные результаты о распределении ВКЭ хорошо согласуются с общепринятым деревом видов класса однодольных растений.

Author Biographies

Лев Израилевич Рубанов, Институт проблем передачи информации им. А.А. Харкевича Российской академии наук

кандидат технических наук, старший научный сотрудник, ведущий научный сотрудник, лаборатория №2

Олег Анатольевич Зверков, Институт проблем передачи информации им. А.А. Харкевича Российской академии наук

кандидат физико-математических наук, старший научный сотрудник, лаборатория №6

Александр Владиславович Селиверстов, Институт проблем передачи информации им. А.А. Харкевича Российской академии наук

кандидат физико-математических наук,  ведущий научный сотрудник, лаборатория №6

Василий Александрович Любецкий, Институт проблем передачи информации им. А.А. Харкевича Российской академии наук

доктор физико-математических наук, профессор, заведующий лабораторией №6

References

1. Гармаш Е.В. Митохондриальное дыхание фотосинтезирующей клетки // Физиология растений. 2016. Т. 63, № 1. С.17–30.
2. de Graaf R.M., Ricard G., van Alen T.A., Duarte I., Dutilh B.E., Burgtorf C., Kuiper J.W., van der Staay G.W., Tielens A.G., Huynen M.A., Hackstein J.H. The organellar genome and metabolic potential of the hydrogen-producing mitochondrion of Nyctotherus ovalis // Mol. Biol. Evol. 2011. V. 28, no. 8. P. 2379–2391. DOI: 10.1093/molbev/msr059
3. Rubanov L.I., Seliverstov A.V., Zverkov O.A., Lyubetsky V.A. A method for identification of highly conserved elements and evolutionary analysis of superphylum Alveolata. BMC Bioinformatics. 2016 17:385 DOI 10.1186/s12859-016-1257-5
4. Ильев В.П., Ильева С.Д., Навроцкая А.А. О задаче кластеризации графа с ограничением на размеры кластеров //Дискретный анализ и исследование операций. 2016. Т. 23, № 3. С. 5–20. DOI: 10.17377/daio.2016.23.521
5. Van Dongen S. Graph clustering via a discrete uncoupling process // SIAM J. Matrix Anal. Appl. 2008. V. 30, №1.P.121–141.DOI:10.1137/040608635
6. Stamatakis A. RAxML version 8: a tool for phylogenetic analysis and post-analysis of large phylogenies // Bioinformatics. 2014. V. 30, no. 9. P. 1312–1313. DOI: 10.1093/bioinformatics/btu033
7. Селиверстов А.В., Лысенко Е.А., Любецкий В.А. Быстрая эволюция промоторов пластомных генов ndhF у цветковых растений //Физиология растений. 2009. Т. 56, № 6. С. 926–934.
8. Lyubetsky V.A., Rubanov L.I., Seliverstov A.V. Lack of conservation of bacterial type promoters in plastids of Streptophyta// Biology Direct. 2010. V. 5, no. 34. DOI: 10.1186/1745-6150-5-34
9. Bailey T.L., Bodén M., Buske F.A., Frith M., Grant C.E., Clementi L., Ren J., Li W.W., Noble W.S., MEME SUITE: tools for motif discovery and searching // Nucleic Acids Research. 2009. V. 37. P. W202-W208.
10. Nawrocki E.P., Burge S.W., Bateman A., Daub J., Eberhardt R.Y., Eddy S.R., Floden E.W., Gardner P.P., Jones T.A., Tate J., Finn R.D. Rfam 12.0: updates to the RNA families database // Nucleic Acids Research. 2015. V. 43, no. D1. P. D130–D137. DOI:10.1093/nar/gku1063
11. Рубанов Л.И. О распараллеливании неоднородных циклов на суперкомпьютерах с распределённой памятью // Информационные процессы. 2013. Т. 13, № 4. С. 295–305.
Published
2016-11-25
How to Cite
РУБАНОВ, Лев Израилевич et al. ВЫСОКО КОНСЕРВАТИВНЫЕ ЭЛЕМЕНТЫ В МИТОХОНДРИЯХ ОДНОДОЛЬНЫХ РАСТЕНИЙ. Modern Information Technologies and IT-Education, [S.l.], v. 12, n. 2, p. 211-215, nov. 2016. ISSN 2411-1473. Available at: <http://sitito.cs.msu.ru/index.php/SITITO/article/view/87>. Date accessed: 26 aug. 2025.
Citation Formats
Issue
Vol 12 No 2 (2016): Современные информационные технологии и ИТ-образование
Section
Big Data and applications
Creative Commons License

This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Publication policy of the journal is based on traditional ethical principles of the Russian scientific periodicals and is built in terms of ethical norms of editors and publishers work stated in Code of Conduct and Best Practice Guidelines for Journal Editors and Code of Conduct for Journal Publishers, developed by the Committee on Publication Ethics (COPE). In the course of publishing editorial board of the journal is led by international rules for copyright protection, statutory regulations of the Russian Federation as well as international standards of publishing. 
Authors publishing articles in this journal agree to the following: They retain copyright and grant the journal right of first publication of the work, which is automatically licensed under the Creative Commons Attribution License (CC BY license). Users can use, reuse and build upon the material published in this journal provided that such uses are fully attributed.